秘書處是一個學生社團聯合會的一個核心部門，也是一個綜合性部門，負責整個學生社團聯合會的公共財產與學生工作情況監督。負責學生社團聯合會的日常工作；各協會的日常考勤的情況統計；協助主席團工作，組織落實主席團安排的各項工作任務，以及組織參與各協會的活動。